Obecność karmelitów bosych w Zawoi sięga 1938 r. Wybudowany w pierwszych latach po wojnie dom oraz kaplica służyły początkowo celom rekolekcyjnym. Dopiero w 1954 r. został założony konwent. W latach 1970-1976 stanął nowy kościół, a także rozbudowano klasztor.

Od dnia 1 stycznia 1976 r. Kuria Metropolitalna w Krakowie powierzyła karmelitom bosym w Zawoi wikariat parafialny. W lacha 1986-1990 powstał nowy budynek klasztoru. Wybudowano również dom oazowy z myślą o przyjmowaniu grup oazowych, rekolekcyjnych i kolonii dziecięcych. Od 2013 r. trwa jego przebudowa.